Tuy nhiên, do thời tiết nắng nóng, tảo độc, tảo hại phát triển trong ao tương đối nhiều nên có 160 ha bị nhiễm bệnh, tỷ lệ thiệt hại lên đến 70%, giá trị thiệt hại từ 30 đến 50 triệu đồng/ha. Bên cạnh dịch bệnh phát sinh thì chi phí sản xuất cao, giá tôm nguyên liệu không ổn định khiến người nuôi tôm gặp nhiều khó khăn.
Để hạn chế dịch bệnh lây lan và giảm thiệt hại, tăng sản lượng, các ngành chức năng huyện Cần Giuộc khuyến khích nông dân nuôi tôm theo hướng ứng dụng công nghệ cao, áp dụng mô hình nuôi sử dụng chế phẩm sinh học, ứng dụng những quy trình nuôi tiên tiến, sử dụng nguồn giống đảm bảo chất lượng…. đồng thời thường xuyên kiểm tra các chỉ tiêu môi trường nước để điều chỉnh và xử lý phù hợp. Ngòai ra, người nuôi tôm cần thường xuyên cập nhật kết quả quan trắc môi trường vùng nuôi trên địa bàn để chủ động trong thả tôm giống và chăm sóc tôm nuôi. Nhất là lưu ý các yếu tố bất lợi khi nuôi tôm nước lợ trong mùa nắng nóng để có biện pháp xử lý kịp thời.